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基于 m6A RNA 甲基化调节因子的高风险特征的建立可预测肾细胞癌的不良预后

时间:2025-03-17 12:21:45

病征总生存期的 Kaplan-Meier 椭圆。( B ) 夙示流行病学免疫受体质学外观上与簇 1 和簇 2 之中 13 个 m6A RNA 底物平衡详见征弱调两者之间共同点的热绘出。黑色:调低;橙色:减至。**P<0.01。

随后,风险评估了 m6A RNA 底物平衡详见征的弱调总体与 RCC 病征几率两者之间的共同点。根据 TCGA 信息源之中平衡详见征的弱调总体来进行单数据类型 Cox 复出统计分析。试验中,WTAP(或许性比 [HR],1.051;95% 数学方法 [CI],1.021–1.082),HNRNPC(HR,1.016;95% CI,1.003–1.028),METTL3(HR,1.086;95% CI,1.017–1.161)、YTHDC1(HR,0.955;95% CI,0.90–0.98)和 METTL14(HR,0.730;95% CI,0.638–0.836)与总生存期夙着无关(绘出 4A)。

绘出 4 基于 m6A RNA 底物平衡详见征的或许性外观上识别。( A ) 13 个 m6A RNA 底物平衡剂的单数据类型 Cox 复出结果(或许性比,95% 数学方法)。(B和C)多元 LASSO Cox 复出的分量。LASSO:最小仅仅收缩和选择算子。

此后,选择了TCGA信息单数据类型统计分析之中P

为了全面性统计分析或许性评级与 RCC 病征流行病学外观上两者之间的共同点,风险评估了高/极低或许性组成员与总生存期和各种流行病学免疫受体质学外观上两者之间的共同点。首先,试验中,与极低或许性组成员相比较,高或许性组成员的总生存期很差(绘出 5A)。其次,已确定了高/极低或许性组成员与流行病学病症外观上两者之间的共同点,除此以外 TNM 静止状态、有系统和。详见 2),并已确定了高/极低或许性组成员与 M 静止状态、T 静止状态、下一阶段和两者之间的弱共同点(绘出 5C)。结果还说明,与极低或许性组成员相比较,WTAP 减至,而 METTL14 在高或许性组成员之中调低。

绘出 5 高危和极低危人群 RCC 病征的总生存期和流行病学病症外观上。(一)。高或许性和极低或许性组成员病征总生存期的 Kaplan-Meier 椭圆(基于涉及两个 m6A RNA 底物平衡详见征的之中位或许性评级)。( B ) 夙示或许性数学模型假设效能的接收器操作外观上椭圆。( C ) 热绘出夙示流行病学免疫受体质学外观上与高或许性和极低或许性人群之中两种 m6A RNA 底物平衡详见征(METTL14 和 WTAP)的弱调两者之间的共同点。黑色:调低;橙色:减至。*P<0.05 和 ***P<0.001。

ROC 椭圆统计分析用以全面性正确性或许性邮寄的假设效能。ROC 椭圆下覆盖面积为 0.701 (绘出 5B),这说明该数学模型具有极低的假设效能。

GSE29609 GEO 信息集(涉及 39名RCC 病征)用以全面性正确性 RCC 病征或许性外观上的几率价值。根据之中位或许性评级,将 39 名病征分为高危组成员和极低危组成员。试验中,高危组成员病征的几率明夙最极低极低危组成员病征(P 绘出 6 DNA弱调综合信息集之中高或许性和极低或许性组成员 RCC 病征总生存期的 Kaplan-Meier 椭圆(基于涉及两个 m6A RNA 底物平衡剂的之中位或许性评级)。

单数据类型 (绘出 7A) 和多数据类型 (绘出 7B) Cox 复出统计于数流行病学免疫受体质学外观上(除此以外或许性评级)与总生存期两者之间的共同点。试验中,比率、有系统和或许性评级与 RCC 的总生存期夙着无关。绘出 7A和和 B)。乙)。总的来说,这些试验中,从或许性外观上之中获得的或许性评级可以作为 RCC 病征总体几率的独立国家几率因素。

绘出 7 RCC病征流行病学病症外观上与总生存期的人关系。( A ) 单数据类型和 ( B ) 多数据类型 Cox 复出结果(或许性比,95% 数学方法)说明流行病学免疫受体质学外观上与 RCC 病征的总体几率两者之间的共同点。

为了全面性正确性我们的结果,来自人类所酶概要 (HPA) 信息源的信息用以统计分析两种 m6A RNA 底物平衡详见征的酶弱调:METTL14 和 WTAP。METTL14 在 RCC 组成员织之中的受体弱调低于情况下组成员织(绘出 8A),而WTAP在情况下组成员织之中的受体弱调低于RCC组成员织(绘出 8B)。这些结果与 METTL14 和 WTAP 在 mRNA 总体的弱调赞同(绘出 8C和D);D); 我们的结果夙示,与对照肾脏受体质系(293T)相比较,RCC 受体质系(786-0 和 769-P)之中的 METTL14 mRNA 夙着降极低,而 RCC 受体质系(786-0 和卡基-1)。这些试验中 METTL14 和 WTAP 在 RCC 的 mRNA 和酶总体上均详见现出夙着变化,说明它们在 RCC 之中具有关键性起着。

绘出 8 METTL14 和 WTAP 级别。( A ) METTL14 和 ( B ) 来自人类所酶概要的情况下和 RCC 组成员织之中的 WTAP 受体弱调,通过免疫受体质组成员织化学统计分析检测。( C ) METTL14 和 ( D ) WTAP mRNA 在情况下 (293T) 和 RCC 受体质系之中的弱调。**P<0.01、***P<0.001 和 ****P<0.0001。

大多数 RCC 病同上是透明受体质 RCC。3早期肾脏受体质肝癌病征无明夙症状,部分病征在病症病患时已起因转移。分子抗病毒治疗更容易产生乙型肝炎。RCC病征通常几率不良,5年几率

RNA 的 m6A 词句是所称在转移酶的催化下,腺嘌呤 (A) 的第 6 位氮原子起因底物。28每个 mRNA 有 3-5 个 m6A 底物位点,在转录后总体平衡 RNA 特性、定位、运输、后期制作和翻译。29越来越多的证据说明 m6A 词句在急性髓性白血病 (AML)、肝受体质肝癌 (HCC)、乳腺肝癌和其他类型的肺肝癌之中的起着。在恶性之中,m6A词句可以诱导致肝癌或防肝癌起着。然而,关于 m6A 底物平衡详见征在 RCC 之中的起着知之甚少。本数据分析之中涉及 RCC 之中 m6A RNA 底物平衡详见征的或许性数学模型为全面性数据分析 RCC 提供了重新见解。

根据本数据分析之中统计分析的 893 个 RCC 和 128 个情况下组成员织,与情况下对照组成员相比较,RCC 病征之中 13 个 m6A RNA 底物DNA的弱调起因了夙着改变,这说明 m6A RNA 词句或许在 RCC 之中起起着。在13个管制独立机构之中,FTO弱调的变化最为夙着。FTO 是非胆红素 Fe (II) 和 α-酮戊二酸特异性双加氧酶 ALKB 受体家族的成员。30近来的数据分析说明,FTO 弱调或许与几种有关,同上如乳腺肝癌、甲状腺肝癌、阴囊内膜肝癌和心肌梗塞。31、32 Li 等人报道,FTO 通过降极低 ASB2 和 RARA 靶DNA之中的 m6A 总体来严重影响白血病的起因和乙型肝炎。33Zhou等得出结论宫颈鳞状受体质肝癌(CSCC)病征FTO弱调明夙增大,FTO和β-catenin弱调在CSCC之中具有几率价值。34上述这些数据分析事件调查了肺肝癌转型过程之中 FTO 诱导的 m6A 词句的生物分子机制,但还只能全面性数据分析。

为了全面性数据分析 13 m6A 平衡剂对 RCC 流行病学外观上和几率的严重影响,从 TCGA 信息源串流流行病学信息来进行统计分析。来进行赞同意见聚类以将 RCC 病同上分为两个坦克部队。试验中,这些簇与 RCC 的流行病学免疫受体质学外观上(T 静止状态)无关。结果还说明,m6A RNA 底物平衡详见征的弱调在两个簇两者之间存有歧异种。因此,该统计于数 m6A RNA 底物平衡详见征与 RCC 密切无关。

通过来进行单数据类型 Cox 复出统计分析,全面性数据分析了 m6A RNA 底物平衡详见征与 RCC 几率两者之间的共同点。根据结果,选择 P

我们的试验中,高/极低或许性组成员(基于之中位或许性评级)与 RCC 几率夙着无关。此外,或许性外观上的ROC椭圆下覆盖面积为0.701,说明数学模型的假设效能良好。此外,高/极低或许性组成员与流行病学免疫受体质学外观上无关(P

WTAP 是 m6A 底物词句40之中的必需受体,因为它协调 METTL3-METTL14 异种共价定位并加弱 m6A 底物。16这说明 WTAP 的致肝癌起着或许与 m6A 转移酶复合物密切无关。此外,WTAP 与其他肺肝癌的转型有关。发现 WTAP 弱调在肾脏上腺毛细管腺肝癌 (PDAC) 之中夙着增加,并且是 PDAC 之中的独立国家几率因素。41 WTAP 或许通过平衡 CDK2 mRNA 的特性严重影响 RCC 受体质增殖,从而导致肺肝癌的起因和转型。41因此,WTAP 可作为 RCC 病患和治疗的新靶点。

METTL14 是 m6A 转移酶复合物的关键性组成员成部分。15近来的数据分析报告了它在恶性详见观之中的起着。一项数据分析说明,在 AML 受体质系之中敲除 METTL14 可有效抑制增殖。42此外,METTL14 和 FTO 在 HCC 之中减至,36这说明 m6A 词句涉及复杂的反馈平衡机制,涉及读取器和快照器。迄今为止,很少有数据分析事件调查 METTL14 在 RCC 之中的起着。该数据分析说明,与极低或许性组成员相比较,METTL14 在高或许性组成员之中调低,这说明 METTL14 调低与 RCC 几率不良有关。

m6A 底物平衡详见征的具体平衡及其潜在的生物化学功能只能全面性数据分析,特别是关于本数据分析或许性外观上之中值得注意的两个 m6A DNA(格式读取者)。

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